FMO－MD

摘要

Fragment Molecular Orbital Method－Based Molecular Dynamicsの略。フラグメント分子軌道（FMO）法を電子状態計算に用いた分子動力学（MD）法の意。FMO法は，タンパク質や分子クラスターなどの大規模系に対する量子化学計算（QM）を目的として考案された。従来のQMによる大規模系の取り扱いは，計算量の問題から非現実的であった。FMO法では，計算対象を適当なサイズのフラグメントに切り分け，フラグメントとフラグメントペアのQM計算から全体のエネルギーを近似する。系全体を一度に扱う必要がなくなるため，計算量が大幅に減少するほか，並列計算によってさらなる高速化が可能である。