Déterminer le profil des gènes microbiens de l'intestin afin de trouver des associations entre les espèces bactériennes que nous hébergeons et des maladies. Nous nous sommes focalisés sur deux pathologies, l'obésité et les maladies inflammatoires chroniques intestinales. L'ADN fécal de 750 individus a été séquence, nous permettant d'obtenir un catalogue de 4 millions de gènes, chaque individu en portant 540 000 en moyenne. C'est un système complexe. Alors qu'entre vous et moi, il n'y a que 0,1 % de gènes de différence, la moitié des gènes bactériens que j'héberge sont différents des vôtres. Seulement 20 % des bactéries qui constituent notre microbiote [ensemble des bactéries de l'intestin] sont cultivables en laboratoire...
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