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Caracterización por electroforesis de campo pulsado de aislamientos de Salmonella Typhimurium recuperados en el programa de vigilancia de enfermedad diarreica aguda en Colombia, 1997-2004

机译:1997年至2004年在哥伦比亚的急性腹泻病监测计划中回收的鼠伤寒沙门氏菌分离株的脉冲场电泳表征

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摘要

Introducción. En Colombia, Salmonella Typhimurium es el segundo serotipo más frecuentemente aislado en muestras clínicas humanas después de S. Enteritidis, y representa el 28,2% (n = 468) de los 1.659 aislamientos recuperados en el programa de vigilancia por el laboratorio de enfermedad diarreica aguda liderado por el Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud. Objetivo. Caracterizar molecularmente los aislamientos de S. Typhimurium que circulan en el país con el fin de establecer su perfil y determinar su relación genética. Materiales y métodos. En 468 aislamientos remitidos por 14 laboratorios de salud pública departamentales, recuperados entre enero de 1997 y diciembre de 2004, se determinó el perfil genómico por electroforesis de campo pulsado con la enzima de restricción XbaI según el protocolo de la Red PulseNet (CDC, Atlanta); el análisis de los geles se realizó con el programa Fingerprinting II. Resultados. Se obtuvieron 180 patrones electroforéticos. Los patrones prevalentes fueron COINJPX.X01.0062, encontrado en 101 aislamientos (21,3%), seguido por los patrones COINJPX.X01.0001 en 40 (8,4%), COINJPX.X01.0058 en 13 (3%), COINJPX.X01.0003 en 12 (2,5%), COINJPX.X01.0066 en 11 (2,3%) y COINJPX.X01.0108 en 6 (1,4%). COINJPX.X01.0001, fue el patrón predominante en Bogotá hasta 2002, reemplazado a nivel nacional por el COINJPX.X01.0062. El análisis de agrupamiento mostró tres grupos con similitudes genéticas entre 53% y 82%, lo que revela la heterogeneidad genética del serotipo. Conclusiones. El estudio permitió identificar patrones electroforéticos prevalentes, tener una base de datos nacional disponible para la comparación de los perfiles en tiempo real, detectar brotes y relacionar casos aparentemente aislados.
机译:介绍。在哥伦比亚,鼠伤寒沙门氏菌是人类临床样本中仅次于肠炎沙门氏菌的第二种最常见的血清型,占实验室监测程序中检出的腹泻病1659株中的28.2%(n = 468)由美国国立卫生研究院微生物学小组领导的急性。目的。分子鉴定在该国流行的鼠伤寒沙门氏菌分离株,以建立其特征并确定其遗传关系。材料和方法。在1997年1月至2004年12月之间回收的由14个部门公共卫生实验室发送的468个分离物中,根据PulseNet网络(CDC,亚特兰大)的限制酶XbaI通过脉冲场电泳确定了基因组图谱。 ;用Fingerprinting II程序进行凝胶分析。结果。获得180个电泳图。流行的模式是COINJPX.X01.0062,在101个分离株中占21.3%,其次是40处的COINJPX.X01.0001(8.4%),13处的COINJPX.X01.0058(3%) ,位于12(2.5%)的COINJPX.X01.0003,位于11(2.3%)的COINJPX.X01.0066和位于6(1.4%)的COINJPX.X01.0108。在2002年之前,COINJPX.X01.0001是波哥大的主要模式,在国家一级被COINJPX.X01.0062取代。聚类分析显示三组的遗传相似性在53%和82%之间,揭示了血清型的遗传异质性。结论。这项研究使识别流行的电泳图型成为可能,拥有可用于实时比较图谱的国家数据库,检测暴发并关联明显孤立的病例。

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