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CELL SEGMENTATION USING HESSIAN-BASED DETECTION AND CONTOUR EVOLUTION WITH DIRECTIONAL DERIVATIVES

机译:使用基于Hessian的检测和轮廓演化和方向导数进行细胞细分

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摘要

The large amount of data produced by biological live cell imaging studies of cell behavior requires accurate automated cell segmentation algorithms for rapid, unbiased and reproducible scientific analysis. This paper presents a new approach to obtain precise boundaries of cells with complex shapes using ridge measures for initial detection and a modified geodesic active contour for curve evolution that exploits the halo effect present in phase-contrast microscopy. The level set contour evolution is controlled by a novel spatially adaptive stopping function based on the intensity profile perpendicular to the evolving front. The proposed approach is tested on human cancer cell images from LSDCAS and achieves high accuracy even in complex environments.
机译:通过生物活细胞成像研究细胞行为产生的大量数据需要准确的自动化细胞分割算法,以进行快速,公正和可重复的科学分析。本文提出了一种新方法,该方法可使用脊线测量进行初始检测,并使用改进的测地线有效轮廓进行曲线演化,从而获得具有复杂形状的细胞的精确边界,从而利用相衬显微镜中存在的光晕效应。水平集轮廓线的演变是通过一种新颖的空间自适应停止函数来控制的,该函数基于垂直于不断变化的前沿的强度分布。所提出的方法在LSDCAS的人类癌细胞图像上进行了测试,即使在复杂的环境中也可以实现高精度。

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