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A subgraph isomorphism algorithm and its application to biochemical data

机译:子图同构算法及其在生化数据中的应用

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摘要

BackgroundGraphs can represent biological networks at the molecular, protein, or species level. An important query is to find all matches of a pattern graph to a target graph. Accomplishing this is inherently difficult (NP-complete) and the efficiency of heuristic algorithms for the problem may depend upon the input graphs. The common aim of existing algorithms is to eliminate unsuccessful mappings as early as and as inexpensively as possible.
机译:背景图可以代表分子,蛋白质或物种水平的生物网络。一个重要的查询是查找模式图与目标图的所有匹配项。要做到这一点本质上是困难的(NP完全),并且针对该问题的启发式算法的效率可能取决于输入图。现有算法的共同目标是尽早且尽可能便宜地消除不成功的映射。

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