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Tavaxy: Integrating Taverna and Galaxy workflows with cloud computing support

机译:Tavaxy:将Taverna和Galaxy工作流程与云计算支持集成在一起

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摘要

BackgroundOver the past decade the workflow system paradigm has evolved as an efficient and user-friendly approach for developing complex bioinformatics applications. Two popular workflow systems that have gained acceptance by the bioinformatics community are Taverna and Galaxy. Each system has a large user-base and supports an ever-growing repository of application workflows. However, workflows developed for one system cannot be imported and executed easily on the other. The lack of interoperability is due to differences in the models of computation, workflow languages, and architectures of both systems. This lack of interoperability limits sharing of workflows between the user communities and leads to duplication of development efforts.
机译:背景技术在过去的十年中,工作流系统范式已经发展成为一种高效且用户友好的方法,用于开发复杂的生物信息学应用程序。酒馆(Taverna)和银河系(Galaxy)是受到生物信息学界认可的两个流行的工作流程系统。每个系统都有庞大的用户群,并支持不断增长的应用程序工作流存储库。但是,为一个系统开发的工作流无法导入并在另一个系统上轻松执行。缺乏互操作性是由于两个系统的计算模型,工作流语言和体系结构上的差异。缺乏互操作性限制了用户社区之间工作流的共享,并导致开发工作重复。

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