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The comprehensive updated regulatory network of Escherichia coli K-12

机译:全面更新的大肠杆菌K-12监管网络

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摘要

BackgroundEscherichia coli is the model organism for which our knowledge of its regulatory network is the most extensive. Over the last few years, our project has been collecting and curating the literature concerning E. coli transcription initiation and operons, providing in both the RegulonDB and EcoCyc databases the largest electronically encoded network available. A paper published recently by Ma et al. (2004) showed several differences in the versions of the network present in these two databases.Discrepancies have been corrected, annotations from this and other groups (Shen-Orr et al., 2002) have been added, making the RegulonDB and EcoCyc databases the largest comprehensive and constantly curated regulatory network of E. coli K-12.
机译:背景大肠埃希氏菌是模型生物,我们对其调节网络的了解最为广泛。在过去的几年中,我们的项目一直在收集和整理有关大肠杆菌转录起始和操纵子的文献,在RegulonDB和EcoCyc数据库中均提供了最大的可用电子编码网络。 Ma等人最近发表的论文。 (2004年)显示了这两个数据库中存在的网络版本的一些差异。已纠正了差异,并添加了该组和其他组的注释(Shen-Orr等人,2002年),使RegulonDB和EcoCyc数据库成为最大的,不断完善的大肠杆菌K-12监管网络。

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