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Compiled data set of exact NOE distance limits residual dipolar couplings and scalar couplings for the protein GB3

机译:精确的NOE距离限制残留的偶极偶联和标量偶联的蛋白质GB3的汇编数据集

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摘要

We compiled an NMR data set consisting of exact nuclear Overhauser enhancement (eNOE) distance limits, residual dipolar couplings (RDCs) and scalar (J) couplings for GB3, which forms one of the largest and most diverse data set for structural characterization of a protein to date. All data have small experimental errors, which are carefully estimated. We use the data in the research article Vogeli et al., 2015, Complementarity and congruence between exact NOEs and traditional NMR probes for spatial decoding of protein dynamics, J. Struct. Biol., 191, 3, 306–317, doi:10.1016/j.jsb.2015.07.008 for cross-validation in multiple-state structural ensemble calculation. We advocate this set to be an ideal test case for molecular dynamics simulations and structure calculations.
机译:我们编辑了一个NMR数据集,该数据集由GB3的确切核Overhauser增强(eNOE)距离限制,残余偶极偶合(RDC)和标量(J)偶合组成,形成了蛋白质结构表征中最大,最多样化的数据集之一至今。所有数据都有很小的实验误差,请仔细评估。我们使用研究文章Vogeli等人(2015年,确切的NOE与传统NMR探针之间的互补性和一致性)中的数据进行蛋白质动力学的空间解码,J。Struct。 Biol。,191,3,306-317,doi:10.1016 / j.jsb.2015.07.008,用于多状态结构集成计算中的交叉验证。我们主张此集是进行分子动力学模拟和结构计算的理想测试案例。

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