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Crystallization and preliminary X-ray diffraction of the RNA demethylase ALKBH5

机译:RNA脱甲基酶ALKBH5的结晶和初步X射线衍射

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摘要

N 6-Methyladenosine (m6A) is a ubiquitous modification found in mammalian mRNA and long noncoding RNA. ALKBH5 is a member of the iron(II)- and 2-­oxoglutarate­-dependent AlkB oxygenase family and has been shown to catalyze the oxidative demethylation of N 6-methyladenosine in RNA. The ALKBH5 protein was purified and crystallized using the hanging-drop vapour-diffusion method. The crystals diffracted to 2.4 Å resolution using synchrotron radiation. The crystals belonged to space group P212121, with unit-cell parameters a = 57.456, b = 83.406, c = 92.909 Å, α = β = γ = 90.00° and one molecule in the asymmetric unit.
机译:N 6 -甲基腺苷(m6A)是在哺乳动物mRNA和长非编码RNA中普遍存在的修饰。 ALKBH5是铁(II)和2-­ oxoglutarate­依赖的AlkB加氧酶家族的成员,已被证明可催化RNA中N 6 -甲基腺苷的氧化脱甲基。使用悬滴蒸汽扩散法纯化ALKBH5蛋白并使其结晶。使用同步加速器辐射将晶体衍射至2.4Å分辨率。晶体属于空间群P212121,单位晶胞参数a = 57.456,b = 83.406,c = 92.909Å,α=β=γ= 90.00°,并且一个分子位于不对称单元中。

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