塔里木兔线粒体基因组全序列分析与系统进化研究

摘要

塔里木兔是我国新疆地区特有物种,已被列为国家Ⅱ级重点保护动物.本研究基于所测定的塔里木兔线粒体全基因组序列(全长17011 bp),进行了全序列的结构分析,结果表明塔里木兔线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区.除了nad6在L链上以外,其他的蛋白质编码基因都在H链上.基于线粒体基因序列,通过生物信息学预测发现除了trnM和trnS1以外,其余tRNA都有经典的三叶草二级结构.线粒体全基因组具有AT偏好性,其结构与目前兔属其他物种线粒体基因组结构类似.并基于塔里木兔和GeneBank已有的12种兔属物种线粒体全基因组序列,分别用ML法和NJ法构建系统进化树,对其系统发生进行了探讨,结果表明塔里木兔与蒙古兔的亲缘关系较近.