PCR Detection and Sequence Analysis of Duck Circovirus in Sick Muscovy Ducks

摘要

在从福建省的病了的鸭的鸭 circovirus (DuCV ) 感染被调查。有传染 serositis 的 43 只病了的俄国鸭的肝样品在福建省从 12 个鸭农场被收集。基于 DuCV 的出版序列，二份教材为 DuCV 的察觉被设计，四份教材被设计放大盖住 DuCV 的完全的染色体的四重叠碎片。特定的聚合酶链反应产品从积极样品被放大。碎片然后被克隆进 pMD18-T 向量并且定序，并且 DuCV 的 FJ0601 isolate 的完整的长度染色体组的顺序被获得。聚合酶链反应分析证明积极因为 circovirus 从 12 个农场是 79% 和 10 的鸭的比例是积极的。顺序分析证明 DuCV-FJ0601 的完全的染色体是 1988 bp 并且拥有了对包括了茎环结构和议员蛋白质主题的家庭 Circoviridae 普通的特征。相同分析证明 DuCV 的那 FJ0601 isolate 有到所有四个台湾的身份孤立的 97.3%∼97.5% 核苷酸序列(TC1/2002， TC2/2002， TC3/2002， TC4/2002 ) ，到美洲(33753-52 )isolate 的 82.9% 身份和到德国的 82.3% 身份孤立。然而，有 Clustal W 的种系发生的分析证明 DuCV 的那 FJ0601 isolate 在有台湾的一个普通分支上孤立，并且德国和美洲孤立属于另外的分支。