贵州地方耐冷水稻品种的SSR遗传多样性分析

摘要

用16对SSR引物对11个贵州地方耐冷水稻品种、2个典型的籼稻品种和2个典型的粳稻品种进行遗传多样性分析,在15份材料中共检测到95个等位基因,每一位点的等位基因变幅为4～12个,平均5.9个,其中有效等位基因70个,有效等位基因的百分数为75.8 %,多态位点百分率为38 %,贵州地方耐冷水稻品种间遗传距离为0.06～0.53.应用NJ法对基于16对SSR标记数据的品种进行聚类分析,结果表明:15份不同材料可分为粳稻组和籼稻组,粳稻组各品种间遗传距离为0.06～0.53,平均遗传距离为0.303,其中贵州地方耐冷水稻品种间的遗传距离为0.21～0.46,籼稻组各品种间遗传距离为0.297～0.377,平均遗传距离为0.329,11个贵州地方耐冷水稻品种除筒恢211外,其他都属粳稻组.用相同SSR标记数据和聚类方法分别对苗期、芽期、孕穗期和开花期耐冷的水稻品种进行聚类分析发现: 同一时期耐冷品种在各自聚类图中的排列位置与全部材料聚类时有所不同,但其亲缘关系远近没有变化.结果表明SSR适合贵州地方耐冷水稻品种的遗传多样性研究和籼粳分类.