矮牵牛Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆与分析

摘要

采用植物Ty1-copia类逆转点子逆转录酶的保守区设计简并引物,经PCR扩增从矮牵牛(Petunia hybrida Vilm.)中扩增出260bp左右的目标条带,扩增产物经测序及序列分析,总共获得了24条逆转录酶序列.结果表明,24条逆转录酶序列长度变化范围为260～272 bp,同源性范围为49.8％～97％,经核苷酸聚类分析分为7个家族.Ty1-copia类逆转录酶在序列长度、碱基组成上具有高度异质性,翻译成氨基酸后,有18条序列是完整的,另外6条序列出现终止密码子突变或移框突变,终止密码子突变和移框突变是矮牵牛Ty1-copia逆转座子高度异质性的重要表现.与已登陆的不同植物物种的Ty1-copia类逆转录酶序列进行同源性分析,结果与部分植物物种具有较高的同源性,可能有共同起源.