基于网络药理学方法分析丁香酚治疗心肌缺血再灌注损伤的作用靶点及相关通路

摘要

目的 基于网络药理学方法分析丁香酚治疗心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的作用靶点及相关通路。方法 将丁香酚“Eugenol”输入TCMSP数据库检索丁香酚作用靶点,将“Myocardial Ischemia Reperfusion Injury”输入GeneCards、OMIM数据库检索MIRI相关靶点;将两者交集后获得丁香酚-MIRI共同靶点,导入String数据库建立蛋白质互作网络(PPI)图,导入Cytoscape3.7.2软件进行聚类分析并寻找核心靶点;将丁香酚-MIRI共同靶点导入Matescape基因富集分析在线工具数据平台,进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 共得到不重复的丁香酚作用靶点100个、MIRI相关靶点1 085个、丁香酚-MIRI共同靶点33个。丁香酚-MIRI共同靶点的PPI图显示每个活性成分平均节点度7.09,PPI富集P值为1×10^(-16)。基于聚类分析的核心靶点筛选结果显示共得到2个基因簇和2个核心基因,核心基因分别为蛋白激酶B-α(Akt1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)。丁香酚-MIRI共同靶点的GO生物功能富集分析结果显示,其主要涉及的生物学过程包括蛋白质磷酸化的正向调节、离子平衡、细胞迁移等,主要涉及的细胞成分包括突触后膜、膜筏、微膜区等,主要涉及的分子功能包括蛋白激酶活性、血红素结合、转录因子等。丁香酚-MIRI共同靶点的KEGG富集通路共有177条,主要包括晚期糖基化终末产物(AGE)—糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、Toll样受体(TLR)信号通路等。结论 丁香酚治疗MIRI的核心靶点主要有Akt1、VEGFA,主要涉及AGE-RAGE、MAPK、TLR等相关通路。