可逆共价抑制剂与肠肽酶的结合机制

摘要

肠肽酶(EP)是一种丝氨酸蛋白酶,可作为治疗代谢性疾病的靶点,肠肽酶的可逆共价抑制剂具有临床相关的疗效。本文以卡莫司他为小分子母体,构建了30个潜在的肠肽酶可逆共价抑制剂,运用AutoDock4.2软件,将30种抑制剂小分子对接到肠肽酶的活性中心。对接结果显示肠肽酶的活性中心的Asp181、Glu210、Ser182、Ser187等残基与抑制剂小分子形成氢键,His41上的芳香性基团与抑制剂小分子上的芳香性基团形成π-π堆积,6,11,18,20,26号抑制剂小分子与肠肽酶对接的结合能分别为-9.98,-9.89,-9.89,-9.83,-9.82 kcal/mol,他们的抑制常数分别为47.96,56.08,55.94,62.58,63.3 nM,表明结合构象较稳定,其中6号抑制剂小分子的对接结果最好。