HIV-1整合酶的RNA适配子的筛选及活性研究

摘要

通过SELEX技术已经筛选到了多种HIV-1病毒相关蛋白,如:逆转录酶、Rev和Tat蛋白、核壳蛋白等的核酸适配子,然而以HIV-1整合酶为靶点的DNA或RNA适配子却鲜有报道.在结合缓冲液中以10mmol·L-1的Mg2+作为辅助因子,加入100mmol·L-1KCl筛选到了三个具有相似结构和Kd的适配子IN1,IN2和IN3.亲和力最高的适配子IN1的Kd为145nmol·L-1,保守区富含鸟嘌呤碱基（G）,缺失任何一个茎环结构会使亲和力减弱.缺失右端固定序列的IN1-L的Kd为283nmol·L-1,虽然不能形成四链结构但可以被G-四链T40214竞争结合,可能与T40214具有相同的结合位点.