中国辣椒热胁迫转录因子的全基因组鉴定及热胁迫响应的初步分析

摘要

采用生物信息学方法,从中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)全基因组序列中鉴定得到28个热胁迫转录因子(HSF)候选基因,并对这些候选基因的染色体分布、基因结构及编码蛋白的3D结构特征进行了分析.结果 显示:28个候选基因的编码蛋白长度为128～526 aa;系统发育分析结果表明,HSF可分为A、B、C3个亚家族.进一步对热胁迫处理后的中国辣椒种质进行转录组分析,共检测到27个HSF转录本,与对照组相比,实验组中有25个基因对热胁迫有不同程度的响应.