盐胁迫下西伯利亚蓼6个时期混合叶cDNA文库的构建和初步分析

摘要

以3%NaHCO_3胁迫处理西伯利亚蓼2 h、6 h、12 h、1 d、2 d和3 d共6个时期混合叶为材料,提取总RNA。根据Stratagene公司cDNA建库试剂盒构建了西伯利亚蓼混合叶cDNA文库。原始文库滴度为2.0×10~6pfu·mL^(-1),扩增后文库滴度为4.5×10~9pfu·mL^(-1),重组率为95.9%,插入片段大小在0.3～1.5 kb之间,平均长度为0.45 kb左右。经测序获得2575个EST序列,拼接出1977个假定独立转录本(TUTs),其中文库中含有大量低丰度表达基因,约占TUTs总数的89.58%。BlastX分析表明,1977个TUTs中共有720个TUTs有明确功能注释,其中参与胁迫过程中代谢、能量、光合作用和蛋白合成基因表达量较高,而涉及转录、信号转导、细胞防御和救援基因表达量较低。