应用改良甲基化间区位点扩增(AIMS)技术对人类全基因组CpG岛甲基化谱的分析

摘要

目的进行人类全基因组CpG岛甲基化谱分析.方法采用改良甲基化间区位点扩增(AIMS)技术,以甲基化敏感和甲基化不敏感的3组同裂酶进行分析.分析6%、8%、10% 3种变性测序胶对于分析人类甲基化谱电泳条带的影响,3种酶切组合的分析效果以及进行放射自显影和分子成像系统分析的对比.结果得到具有个体差异的人类基因组CpG岛甲基化图谱,为后续研究奠定了基础.6%变性测序胶所得电泳条带的分辨率和条带范围明显优于8%和10%变性测序胶.3种酶切组合均可以很好地进行AIMS分析.放射自显影和Personal Molecular Imager FX分子成像系统两种方法相辅相成.结论改良AIMS技术是一种甲基化高通量分析方法,具有简单、特异、易操作的特点.所选3组内切酶组合可以较全面的覆盖人类CpG岛,使分析结果更加准确,且所需的基因组量少,可满足临床微量标本检测的需要.