整合转录组学识别食管鳞癌关键基因细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子3

摘要

目的 运用整合转录组学方法 筛选参与食管鳞状细胞癌(ESCC)发生发展的相关基因,并观察其临床意义.方法 从GEO数据库中下载ESCC表达谱的原始文件,使用R软件中的affy包读取数据并归一化,Robustrankaggreg包对各表达谱整合,以|Log2(倍数变化)|≥1.5和矫正0.05);不同N分期及临床分期的ESCC患者CDKN3蛋白表达比较,差异有统计学意义(P<0.05).结论 CDKN3在ESCC组织及癌旁组织中表达存在差异,其可能是ESCC的关键基因;另外,CDKN3的表达与患者N分期及临床分期有关,其可作为诊断ESCC的生物标志物.