乳腺癌外泌体中小分子RNA表达分析

摘要

目的分析乳腺癌外泌体中小分子RNA(small RNA)的表达。方法采用NextSeq CN500测序仪检测乳腺癌细胞株外泌体和人正常乳腺上皮细胞株外泌体中small RNA的表达,DEGseq R包分析各small RNA表达差异,log2FC>1,FDR<0.05为差异有统计学意义。结果乳腺癌细胞株外泌体相对人正常乳腺上皮细胞株外泌体、34种微小RNA(miRNA)、39种转运RNA来源的小RNA(tsRNA)、和17种tsRNAs表达上调;104种miRNAs、21种与Piwi蛋白相作用的RNA和21种tsRNAs表达上调。结论乳腺癌细胞株外泌体与人正常乳腺上皮细胞株外泌体间small RNA存在表达差异。