实验用藏猪和巴马小型猪线粒体DNA控制区碱基序列比较

摘要

目的:分析比较实验用藏猪和巴马小型猪线粒体DNA控制区D-loop区碱基序列的差异,探讨小型猪的遗传标记。方法:提取59头藏猪和16头巴马小型猪血液基因组DNA,设计特异引物扩增mtDNA D-loop,从凝胶中纯化后直接测序,进行比较。结果:2种小型猪mtDNA D-loop都存在串连重复序列区和非重复序列区(5′端和3′端);重复序列区处于中间位置,藏猪有2种类型(A型和B型),巴马小型猪只有1种类型(A型);藏猪D-loop5′端(704bp)发现有20个变异位点,其中有3个主要的转换位点:305,500,691,巴马小型猪未发现多态位点,与藏猪以及其他猪相比,巴马小型猪D-loop5′端在180、404位有2个碱基差异。结论:藏猪mtDNA D-loop区碱基序列存在2种类型(A型和B型);巴马小型猪mtDNA D-loop区碱基序列多态性较低,有2个遗传标记位点。