氨基酸残基的空间效应对蛋白质α-螺旋中氢键(HHB)稳定性的影响

摘要

本文计算了α-螺旋中氨基酸残基原子的空间坐标,求出侧链原子的位置,分析侧链对水分子的空间屏蔽作用以及对螺旋氢键(HHB)的稳定作用。结果表明:在α-螺旋中,Gly以及β-碳原子上直接接有极性基团的氨基酸残基对水分子的屏蔽作用小,因而降低HHB的稳定性,由这些氨基酸形成的肽链就不利于α-螺旋的稳定;非极性氨基酸以及极性基团不直接接在β-碳原子上的氨基酸残基对水分子的屏蔽作用较大,因而增强HHB的稳定性,由这些氨基酸形成的肽链有利于α-螺旋的稳定。