SARS-CoV-2病毒全基因组序列比对及进化分析

摘要

SARS-CoV-2病毒株是β属冠状病毒,它包括S、N、E、M 4个主要编码蛋白,是造成中国湖北省武汉市爆发重大公共卫生事件的罪魁祸首,目前对该病毒的系统性研究分析并不是很多.运用计算机辅助软件工具来对筛选自NCBI基因文库中的36条来自不同国家地区的SARS-CoV-2病毒株序列进行全序列比对分析,从而找出SARS-CoV-2病毒株可能存在的易变异区域,以及对所有序列的同源性及亲缘性进行分析,找出其传播径途及区域进化特点.通过对不同地区的SARS-CoV-2病毒株序列比对分析发现,SARS-CoV-2病毒株的ORF1ab蛋白编码区及S蛋白编码区存在高度变异性,为SARS-CoV-2病毒疫苗及相关药物的研制提供了相关参考.随后结合进化树和同源性进行分析发现,流行于美国等地区的SARS-CoV-2病毒与中国武汉发现的SARS-CoV-2病毒虽然有着相同的祖先,但其进化分支却是不同的,为SARS-CoV-2病毒的追根溯源提供了相关依据.