丙型肝炎病毒2a型E2区基因cDNA的变异分析

摘要

目的　了解丙型肝炎病毒 2a型基因组E2区序列的一级结构及变异特征 ,为进一步研究HCV包膜蛋白的生物学功能打下基础。方法　用逆转录套式多聚酶链反应 (RT -nPCR)法从 1例NANB型肝炎患者血清中扩增出一条约 110 0bp的片段 ,以限制性内切酶EcoRI、HindⅢ双酶切后连入pUC19载体中 ,转化感受态细胞 ,经限制性内切酶长度多态性分析 (RFLP)和PCR法证实为阳性克隆后 ,用全自动序列分析仪测序。结果　测得约 110 0bp的核苷酸序列 ,其核苷酸序列及其编码的氨基酸序列分别与HCV - 1、HC -C2、HCV -BK、HC -J6、HC -J8相应序列作比较 ,显示分离株HCV在核苷酸水平上与以上分离株的同源性分别为 6 3.1%、6 4 .2 %、6 4 .1%、86 .9%、6 9 3% ,在氨基酸水平上的同源性分别为 6 9.6 %、70 .7%、6 9.6 %、86 .2 %、83.1%。结论　分离株 (HCV -JF)与HC-J6同属 2a型。