Rv1635c基因及其编码蛋白质基本特性及抗原表位的生物信息学分析

摘要

对基因Rv1635c进行生物信息学分析,并对其T、B细胞的抗原表位性进行预测和筛选.用软件ProtParam、SingnalP、TMHMM分别对该基因编码蛋白质的理化性质、信号肽区进行分析预测.以NetMHC、Bimas、NetCTL和SYFPEITHI四个软件来预测分析Rv1635c的T细胞表位.采用IEDB和Bcepred来预测该基因的B细胞表位.分析结果为该基因编码的蛋白质原子总数8573,氨基酸数目556,分子质量60035.23,理论等电点9.84,理论分子式C2772H4323N747O717S14,估计半衰期30 h,不稳定指数39;由SignalP分析得到其不含信号肽;根据TMHMM分析可知Rv1635c为跨膜蛋白;T、B细胞表位预测显示该基因至少含有一个潜在的T、B细胞表位,可为未来疾病的预防、诊断和治疗提供理论基础.