人和猪神经脱细胞基质蛋白质组学差异

摘要

目的:分析猪与人外周神经在脱细胞后的蛋白质组学差异,为猪神经脱细胞材料运用于外周神经损伤(PNI)的修复提供一定的数据支撑.方法:通过研磨和酶解方式提取猪神经脱细胞基质(pDNM)和人神经脱细胞基质(hDNM)内的所有蛋白,采用以串联质量标签(TMT)为标记的液相色谱质谱联用(TMT-HPLC-MS/MS)技术定量并对2组差异蛋白进行GO富集化和KEGG通路分析.结果:共鉴定1448种蛋白,组间蛋白都能明显区分,组内蛋白相关性良好.其中,pDNM上调蛋白数456个,下调蛋白数170个,且pDNM富含更多的细胞外基质(ECM)相关蛋白.GO分析显示,上调表达蛋白所处的细胞位置集中在生长锥、轴突、神经元胞体.上调表达蛋白参与的生物学过程为细胞迁移、细胞骨架组织、轴突发育.上调蛋白的主要分子功能与生物功能调节、细胞骨架的结构组成、肌动活性有关.KEGG通路分析显示,差异蛋白可参与肌动蛋白细胞骨架的调节、轴突的引导等信号通路的激活.结论:pDNM内含丰富的结构和功能相关蛋白,有望成为修复PNI的备选产品.