虚拟筛选和分子动力学模拟研究:筛选弗林蛋白酶的潜在抑制剂

摘要

通过分子对接和分子动力学模拟的方法,进行基于弗林蛋白(Furin)受体的虚拟筛选,以寻找Furin的潜在抑制剂。利用Sybyl软件构建基于Furin受体的药效团模型,在ZINC数据库中筛选出符合药效团模型的小分子,将小分子与Furin蛋白进行分子对接,最终筛选出4个符合条件的小分子。对4个复合物进行100 ns分子动力学模拟,并对轨迹进行RMSD和RMSF分析。通过分子力学-广义Born表面积法(MMGBSA)分析Furin受体和小分子配体平衡后的结合能,对比发现ZINC7664的结合能最低。所以小分子ZINC7664与Furin受体的结合最稳定,具有较好的应用前景,可用于设计有效的抑制Furin的药物。