子宫内膜异位症全基因组甲基化的研究

摘要

目的子宫内膜异位症(endometriosis,EM)是妇科的多发病和常见病,发病率逐年增加。但内异症的发病机制至今并不明确。EM类似恶性肿瘤的生物学行为可能是EM重要的发病机制之一,而恶性病变的发生、发展是以抑癌基因和癌基因遗传变异的积累为标志的,尤其是抑癌基因的异常甲基化。方法抑癌基因非甲基化的Cp G岛异常甲基化与人类恶性肿瘤的发生、转移密切相关。本实验采用成组病例对照方法,选取以手术病理确诊为卵巢型EM的汉族妇女6例为研究对象,选取患者的在位内膜组织标本和异位内膜组织标本各6例,选择同期住院患者中族别、年龄、文化程度等构成比相似的非EM的汉族妇女6例为对照组,选取患者的正常在位内膜组织标本6例。采用美国illumina公司生产的illumina Human Methylation450K Beadchip全基因组甲基化芯片进行全基因组甲基化研究,通过对全基因组甲基化芯片的总共48万个甲基化位点进行综合生物信息学分析。结果通过对EM患者原位和异位内膜组织样品的全基因DNA甲基化修饰进行检测,并进行聚类分析、主成分分析、GO功能注释和KEGG信号通路分析,发现在EM患者的全基因甲基化修饰水平发生了显著变化。对差异甲基化的基因进行GO功能注释,结果发现富集的GO条目主要集中于免疫过程的抗原呈递和干扰素Y的相关通路,分子功能主要集中在协同转运、负离子跨膜转运等活性,而KEGG通路分析发现,1型糖尿病,自身免疫性甲状腺疾病相关信号通路被显著富集。其中,富集程度最高的通路是focal adhesion通路,参与其中的蛋白分子包括ECM-受体互作,细胞因子-受体互作,这些结果为揭示新的EM的发病分子机制提供了参考。结论该实验为EM病因学研究提供新的理论依据,从而为EM分子生物学发病机制的研究提供新思路。