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非酒精性脂肪性肝病患者的肝组织差异蛋白的定量分析:基于iTRAQ技术

         

摘要

目的 应用蛋白质组学在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)肝脏组织中筛选差异蛋白,寻找关键的作用靶点.方法 收集符合纳入标准的肝脏组织,通过HE染色病理切片筛选出非酒精性脂肪性肝炎样本(NASH组)3例和正常对照样本3例.提取NASH组及正常对照组的肝脏蛋白,使用iTRAQ试剂对多肽进行标记进行液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)检测,用蛋白质鉴定软件Mascot2.3.02比对UniProt蛋白数据库搜索鉴定,应用GO数据库对差异表达蛋白质进行注释和富集,应用KEGG数据库进行差异蛋白质涉及信号通路富集.实时荧光定量PCR(qPCR)检测显著差异表达蛋白对应的mRNA表达水平.结果 NASH组和对照组相比,以差异倍数(>1.2或2.0或<0.5)且P<0.05的25个显著差异表达蛋白进行筛选,共有6个蛋白与蛋白组学的结果趋势一致,包括5个下调蛋白:Jumonji蛋白(JARID2)、莱伯西林样蛋白(LCA5L)、突触素1(SYN1)及胶原α-1(XIII)链(COL13A1)、FYVE,RhoGEF和PH结构域蛋白5(FGD5),以及1个上调蛋白:谷胱甘肽S-转移酶Mu 4(GSTM4).结论 iTRAQ技术和生物信息学方法在NASH肝脏组织筛选出差异表达蛋白648个,其中JARID2、SYN1、COL13A1、FGD5、GSTM4可能是NASH的关键靶向蛋白.

著录项

  • 来源
    《南方医科大学学报》 |2021年第9期|1381-1387|共7页
  • 作者单位

    重庆医科大学附属第一医院感染科 重庆 400016;

    重庆医科大学附属第一医院感染科 重庆 400016;

    重庆医科大学附属第一医院感染科 重庆 400016;

    重庆医科大学附属第一医院感染科 重庆 400016;

    重庆医科大学附属第一医院感染科 重庆 400016;

    重庆医科大学附属第一医院感染科 重庆 400016;

    重庆医科大学附属第一医院感染科 重庆 400016;

    重庆医科大学附属第一医院感染科 重庆 400016;

    重庆医科大学附属第一医院感染科 重庆 400016;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    非酒精性脂肪肝; 蛋白组学; 差异性蛋白; 生物信息学;

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