呼伦贝尔市啮齿动物携带汉坦病毒的基因分型研究

摘要

为了研究内蒙古自治区呼伦贝尔市啮齿动物中汉坦病毒(HV)的型别及携带病毒情况,采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原,用RT-PCR法扩增阳性标本中HV的S(620～999nt)片段,使用clustalX(1.83)以及Phylip 3.63构建系统发生树进行分型研究.结果表明,在呼伦贝尔市HFRS疫点共捕获啮齿动物185只,在7份鼠肺样品中检测到HV抗原,其中6只为黑线姬鼠,1只为大林姬鼠,病毒携带率为3.78%.扩增到其中6份HV抗原阳性样品中S片段(620～999nt),分析获得的序列表明与现有的HTNV有最高的同源性,均为HTNV.其中NAa90、NAa118、NAa121和NAp137这4株病毒与分离自黑龙江黑线姬鼠的Bao14株分在同一分支,与病毒的亲缘关系最近,而NAa78、NAa100这2株病毒构成另一分支,与A9株的同源性为94.5%～95.5%,用部分M (2001～2301nt)片断的核苷酸序列构建的系统进化树与S片段的结果一致.结论:呼伦贝尔市的黑线姬鼠与大林姬鼠携带不同亚型的HTNV,表现出HTNV在同一地区的遗传多样性.