抑制剂RVX08、SF2535、RVXOH与BRD4蛋白第一结构域结合模式的分子动力学研究

孙鲁艳; 苏静; 闫芳芳; 刘新国; 张少龙

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该工作采用分子动力学模拟和主成分分析等方法研究了抑制剂SF2535、RVX08和RVXOH与BRD4蛋白第一结构域(BRD4-1)的结合对BRD4-1蛋白构象的影响.此外,为进一步研究三个抑制剂与BRD4-1蛋白的结合能力,采用分子力学泊松-玻尔兹曼表面积(MM-PBSA)方法计算了抑制剂与BRD4-1蛋白的结合自由能.结果表明SF2535与BRD4-1蛋白的结合能力最强.本研究不仅有助于更好的了解BRD4-1的功能和内在动力学,而且还可为以BRD4-1为靶标的有效抗癌药物的研发提供理论基础.

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来源
《山东师范大学学报：自然科学版》 |2019年第1期|76-83|共8页
作者
孙鲁艳; 苏静; 闫芳芳; 刘新国; 张少龙;
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作者单位

山东师范大学物理与电子科学学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类分子物理学;
关键词
分子动力学模拟; BRD蛋白; 主成分分析; MM-PBSA;

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