甜菜应答盐胁迫的RING型E3连接酶基因的鉴定与分析

摘要

甜菜是藜科两年生植物,是我国重要的耐盐糖料作物.以甜菜(Beta vulgaris L.)710-Mu品系为研究对象,利用转录组数据获得盐胁迫下35个RING型E3泛素连接酶基因,从中筛选出9个上调表达的RING型基因,用于后续研究.对这些RING基因进行了保守结构域、染色体定位、理化性质和蛋白互作网络等生物信息学分析.发现9个RING基因在Chrom02、Chrom05、Chrom06、Chrom07、Chrom08和Chrom09上均有分布,并且具有典型的RING-H2型结构域,是潜在的编码RING型泛素连接酶的基因.蛋白质互作分析结果表明,这些RING型蛋白质之间存在相互作用,并与泛素蛋白酶体系统中其他组分,如泛素藕合酶以及26 S蛋白酶体,共同作用调控蛋白质稳态.荧光定量PCR结果说明,转录组数据可信,可作为下一步筛选基因的参照.这些结果可为后续深入研究甜菜泛素连接酶提供理论基础.