基于主成分特征投影法建立利用16S rRNA基因序列进行物种分类方法的研究

摘要

提出一种有别于系统发育树的根据16S rRNA基因序列进行物种分类的新方法.首先将基因的碱基字母形式转换成数字形式,构建多维向量.然后根据主成分分析方法将该向量向数据分布最大方向投影,将原数据用几个“主成分”线性袁出,而不丢失原数据的信息,采用主成分的显示功能作出三维主成分特征投影视图,达到分类的目的.在双歧杆菌和肠球菌的分类识别中得到较好的应用.