胃癌肿瘤突变负荷相关差异基因的研究

摘要

目的：筛选影响胃癌肿瘤突变负荷（TMB）高低的关键差异基因，为胃癌的诊治提供新思路。方法：本研究数据均下载自癌症和肿瘤基因图谱（TCGA）数据库，并通过R软件进行数据分析。我们对高、低TMB组进行差异基因分析、基因本体（GO）富集分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号转导途径分析和蛋白质—蛋白质相互作用（PPI）网络构建。结果：本研究在高低负荷差异基因分析总共发现491个差异基因。GO富集分析主要集中在生物过程（BP）、细胞成分（CC）和分子功能（MF）3个方面。KEGG信号转导通路分析主要包括26个信号转导通路。PPI分析共筛选出了7个最为关键的Hub基因。结论：发现影响胃癌的肿瘤突变负荷高低的最为关键Hub差异基因MYH11、TAC1、ALB、DMD、FGFR1、IGF1和AOX1,其中AOX1为首次发现，这有望为胃癌治疗方式的选择提供新思路。