自组织神经网络算法在低氧大鼠脑细胞凋亡相关基因表达谱分析中的应用

摘要

运用自组织神经网络算法分析复方党参对模拟高原低氧条件下大鼠脑神经细胞凋亡基因表达谱的作用,从中药与生物体基因网络相互作用的角度,探讨了复方党参的作用机制.将Wistar大鼠置于模拟海拔7000m的低压氧舱建立高原低氧大鼠脑细胞凋亡模型,于上舱前7d开始灌复方党参液.提取空白对照组、低氧8d对照组、常氧复方党参组及低氧8d复方党参组大鼠脑组织总RNA,经逆转录合成cDNA探针,用[α-32P]标记探针,各自与Atlas cDNA Array膜杂交,经严格的冲洗后用磷屏检测cDNA表达水平.获得的基因表达谱数据集采用自组织神经网络算法(SOMs)分析.结果显示,低氧可以启动细胞凋亡的线粒体途径,导致细胞死亡;而复方党参以凋亡相关基因网络中的多种成分为靶点,从不同层次上发挥抑制细胞凋亡的作用.