动脉粥样硬化斑块破裂的关键免疫相关基因和潜在治疗药物的识别

摘要

目的:本研究旨在识别可能与动脉粥样硬化斑块破裂(APR)有关的关键免疫相关基因和潜在治疗药物。方法:下载GSE41571、GSE120521和E-MTAB-2055数据集并合并为一个数据集。提取免疫相关差异表达基因(DEIRGs),并构建DEIRGs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,利用分子复合物检测(MCODE)插件筛选关键hub基因。然后,利用cMap预测靶向DEIRGs治疗AS斑块破裂的候选化合物,并将其与hub基因进行了分子对接。同时,评价了hub基因的诊断效能,并开展hub基因的单基因基因集富集分析(GSEA)。结果:共获得29个DEIRGs,筛选出8个hub基因(即CD14、CSF1R、FCER1G、FCGR3A、HCST、ITGB2、S100A9和TYROBP)。cMap预测结果显示,9个候选化合物表现出了靶向DEIRGs治疗APR的潜在作用。8个hub基因在合并数据集中的曲线下面积(area under the curves, AUCs)均大于0.7,提示其具有良好的诊断APR的效能。单基因GSEA显示,8个hub基因高表达组共同富集到了B细胞受体信号通路、趋化因子信号通路、NOD样受体信号通等16个信号通路。结论:本研究发现了8个hub基因在APR的进展过程中起关键作用,9个候选化合物表现出了靶向DEIRGs治疗APR的潜在作用,结果为后续从免疫学角度探索APR的机制及治疗提供了新的思路和切入点。