鳜属3个物种的遗传多样性分析

摘要

本研究在实验室已有的转录组结果的基础上，从测序结果中随机选出部分微卫星位点进行多态性研究，并利用其中25个具有多态性的SSR（simple sequence repeat）位点，对3个鳜属物种斑鳜、翘嘴鳜和大眼鳜进行遗传多样性研究，分析其遗传结构和亲缘关系．实验结果显示，在3个野生物种中共检测到324个等位基因；每对引物检测到的等位基因数为3～23个；平均等位基因数为12.96个．其中共有21个位点属高度多态位点，其平均观测杂合度为0.5234，平均期望杂合度是0.7944，平均多态信息含量为0.7010，这表明3个物种在各检测位点中具有较好的多态性．对数据进行F-检测，25个微卫星位点的Fst值为0.0400～0.6340，平均Fst值是0.2000，说明3个鳜属群体间的分化程度存在差异，在部分位点处，分化程度较高．斑鳜和大眼鳜间Nei氏遗传距离最大，为1.7734；翘嘴鳜和大眼鳜的遗传距离最小，为0.3714．根据遗传距离进行的UPMEGA法聚类分析显示翘嘴鳜和大眼鳜聚为一支，斑鳜独自为一支．