单细胞RNA-seq数据缺失元素补全算法

摘要

基于非负矩阵分解模型,提出一种新的数据补全算法.该算法通过循环遍历确定最佳构造矩阵和rank值,解决了单细胞转录组测序(RNA-seq)数据中存在缺失值的问题,避免了由于单细胞测序深度不足对细胞分型分析的影响.在慢性粒细胞白血病单细胞测序数据上的实验结果表明,由补全算法恢复缺失值后的细胞分型更清晰,验证了该算法的有效性.