一种新的甘露糖结合凝集素——朱顶兰凝集素基因的克隆及序列分析

摘要

运用同源克隆的方法设计简并引物，通过3’和5’RACE技术，从石蒜科植物朱顶兰(Amaryllis vittata Ait)总RNA中克隆了编码此凝集素(AVA)的全长cDNA序列。该基因全长686bp，起始密码子位于第41～43bp，终止密码子位于515～517 bp处，开放阅渎框长474bp，编码158个氨基酸，包含信号肽序列、成熟蛋白序列和C-末端剪切序列的前体蛋白。成熟蛋白由109个氨基酸残基组成，分子量为11．9kD。成熟蛋白在氨基酸水平上与雪花莲凝集素、水仙凝集素、石蒜凝集素和君子兰凝集素分别有73．4％、85.3％、80．7％和83．5％的同源性；朱顶兰凝集素的分子模式显示其与雪花莲凝集素有极其相似的三维结构；在Blocks数据库中检索AVA蛋白氨基酸序列的结构域，发现有3个凝集素功能结构域，并具有3个典型的甘露糖专一结合位点盒(QDNY)。