Transcriptome Profiling Reveals Auxin and Cytokinin Regulating Somatic Embryogenesis in Different Sister Lines of Cotton Cultivar CCRI24

摘要

在在棉花(Gossypium hirsutum L.) 位于体的 embryogenesis (SE ) 下面的分子的机制上得到一个更宽广的看法，棉花 transcriptome 动力学的全球分析用 RNA-Seq 在在不同姐妹线的 SE 期间被执行。204349 unigenes 的一个总数被 214977462 Illumina 的汇编读的 de novo 检测。量的反向的 transcriptionpolymerase 链反应(qRT-PCR ) 大小断然与几乎所有测试基因的 RNA-Seq 结果被相关(R2=0.841，关联在 0.01 水平是重要的) 。不同植物激素(植物生长素和细胞激动素) 在媒介和在在不同姐妹线的二个阶段的这二植物激素的内长的内容变化的集中比率在棉花 SE 期间建议了植物生长素和细胞激动素的角色。根据植物激素相关的基因的全球基因规定，从所有差别的众多的基因表示了抄本涉及植物生长素和细胞激动素生合成和信号 transduction 小径。差别的分析表示了涉及揭示的这些小径的基因在在二根姐妹线之间的基因类型和丰富的实质的变化。隔离，克隆并且在棉花 SE 期间揭示了显著起来表示或下面表示的基因是的 silencing/overexpressing 重要。而且，植物生长素和细胞激动素与对方或另外的因素遗体一起在 SE，而是潜在的串音起一个主要作用不清楚。