基于深度学习算法预测5种金属离子配体结合残基

摘要

金属离子是一种重要的蛋白质结合配体,蛋白质与离子配体结合才能实现其功能,预测蛋白质—金属离子配体结合残基对分子药物设计研究具有重要意义.本文以5种金属离子配体为研究对象,基于蛋白质序列,使用深度学习算法对蛋白质—金属离子配体结合残基进行预测,五交叉检验下得到了较好的预测结果.通过对深度学习算法超参数进行优化,预测性能进一步提升.在最优超参数下,深度学习算法独立检验的预测结果好于随机森林算法.