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剪接因子SRSF7新的mRNA剪接异构体及在顺铂处理的细胞中的变化

         

摘要

目的:探讨不同梯度浓度顺铂(CDDP)处理不同肺癌细胞后新发现的剪接因子SRSF7mRNA异构体在同浓度CDDP处理后不同的细胞中的水平变化。方法:采用梯度浓度的CDDP处理肺癌细胞A549(8、18、24、32、40、48及56μmol/L)和H1299(12、24、36、48、60、72及84μmol/L),处理24h后提取总RNA,进行RTPCR检测SRSF7mRNA剪接异构体,并选取NCBI中未确定的异构体进行TA克隆后测序并分析鉴定异构体类型;用56μmol/L的CDDP处理人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞CaSki、SiHa、C33A细胞24h,提取总RNA后验证新发现的SRSF7mRNA剪切异构体是否存在这些细胞中。结果:发现3种新的SRSF7mRNA剪接异构体(分别标记为New1、New2及New3),在肺癌细胞A549、H1299,人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞CaSki、SiHa、C33A细胞等多种肿瘤细胞中均存在,根据NCBI的预测New1,New2,New3异构体均为非编码蛋白的mRNA异构体,随着处理CDDP浓度的增加,其比例明显上升;而编码蛋白的mRNA异构体a和(或)b所占比例明显下降;同时SRSF7的总mRNA水平逐渐降低。结论:新发现的3种非编码的mRNA异构体的变化揭示细胞可能通过SRSF7自身的mRNA选择性剪接来应对DNA损伤。

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