鲉形目鱼类DNA条形码分析及鲉科DNA条形码电子芯片建立

摘要

为建立鲉形目内各物种的快速鉴别方法,本研究扩增了我国47个鲉形目物种并下载了GenBank上收录的鲉形目共计23科85属233种873条细胞色素C氧化酶Ⅰ基因(COI)序列,分析该基因结构特性.结果表明,鲉形目DNA条形码基因的碱基变异中,不变位点508个,占总位点数的82.1％;转换位点70个,颠换位点41个,分别占总位点数的11.3％和6.6％;种内遗传距离为0～0.019,平均遗传距离为0.003±0.0034;属内种间遗传距离为0.003～0.258,平均值为0.086±0.038;基于233个物种的COI序列构建的系统进化树显示,227个物种(97.4％)能聚为独立分支,且具有较高支持度.在此基础上以鲉科11属39种鱼类的DNA条形码为例,筛选出25个种的37个特异性探针,以此探针对鲉科鱼类进行物种快速鉴定成功率为64.1％,研究结果表明DNA条形码芯片用于鲉科的鉴定具有一定的可行性.