基于高通量测序的牛床垫料发酵过程细菌群落变化研究

摘要

为了探讨在外源菌剂作用下使用了3年的牛床垫料堆肥发酵过程中细菌群落变化的规律,采用三代高通量测序方法研究了牛床垫料堆肥发酵过程细菌群落的相对丰度、群落多样性及组成结构等的变化。结果表明:(1)添加腐熟菌后有利于牛床垫料的发酵进程,温度>50℃的时间保持了16 d,而对照和添加单一菌剂枯草芽孢杆菌则没有这种效果;(2)各处理牛床垫料发酵过程优势菌均为变形菌、拟杆菌、厚壁菌和放线菌等,发酵50℃以上的主要优势菌为厚壁菌,其在发酵7 d最高,发酵21 d和28 d相对丰度则显著降低(P<0.05);常温优势菌为变形菌和拟杆菌,其在发酵28 d相对丰度最高,显著高于发酵7和14 d(P<0.05);放线菌在高温期相对丰度显著高于降温期(P<0.05);(3)发酵14 d,菌剂对堆肥细菌数量影响较为明显,其中FS处理的变形菌和拟杆菌相对丰度显著降低,而厚壁菌和放线菌相对丰度显著升高(P<0.05)。研究结果揭示,细菌数量和群落结构受取样时间的影响大于菌剂。