计算机软件模拟α-乳白蛋白与皂苷的分子对接

摘要

皂苷小分子具有很强的生理活性,在人体中必须与靶细胞生物大分子相互作用才能发挥其生物作用。α-乳白蛋白(α-lactalbumin,α-LA)是球状蛋白质,能结合疏水配体,在食品工业作为功能性配料。采用计算机模拟的方法,对2类皂苷(达玛烷型皂苷和齐墩果型皂苷)和α-LA相互作用进行研究,并获得其相互作用模式的相关图像。分子对接结果表明,2种类型的皂苷与α-LA活性口袋内的氨基酸残基均以疏水相互作用及氢键作用结合,但达玛烷型皂苷结构更复杂,可以提供更多结合位点,且其形成氢键的作用力更强。