miR-107靶基因的生物学分析

摘要

目的:利用生物信息学方法对miR-107的靶基因及功能进行预测,为后续深入研究其生物学功能提供实验验证的理论基础.方法:使用PubMed检索miR-107相关的文章并进行分析总结.通过UCSC基因组浏览器、TargetScan、miRDB、TargetMiner、DAVID等在线工具分析miR-107序列,预测miR-107的靶基因,并对预测的靶基因进行功能富集(GO)分析和信号通路分析.结果:miR-107序列在各个物种间具有高度保守性.文献检索的结果显示,miR-107在一些肿瘤中发挥抑癌基因的作用,而在另一些肿瘤中发挥癌基因的作用.同时miR-107与阿尔茨海默病发病机制有关.GO分析发现miR-107靶基因涉及的分子功能主要包括泛素结合酶和蛋白丝/苏氨酸激酶活性;生物过程涉及泛素蛋白酶转移和膜内陷;细胞组成包括核浆和核内体(P<0.05).靶基因涉及的信号通路有mTOR信号通路、胰岛素抵抗和cGMP-PKG信号通路等(P<0.05).结论:miR-107可能参与多种重要的生物学过程,并作为双向调节因子调控肿瘤的生物学行为.