獭兔酪氨酸酶相关蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外显子多态性研究

摘要

[目的]探索獭兔酪氨酸相关蛋白1(Tyrp1)基因在毛色形成过程中的分子机制.[方法]对獭兔Tyrp1基因序列的核苷酸序列、编码产物的基本理化性质等进行预测和分析,同时利用PCR-SSCP(Single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products)技术检测Tyrp1基因CDS序列的多态性分布状况.[结果]信息学分析发现,TYRP1蛋白是不稳定的亲水性蛋白,有信号肽,具有酪氨酸酶家族特征性功能结构域.多态性检测发现仅在Tyrp1基因CDS的483 bp处存在1个C→T的同义突变,位于外显子2上,该碱基的突变没有造成氨基酸的改变(AUC→AUT,异亮氨酸).Hardy-Weinberg平衡检验表明,青紫蓝色獭兔群体处于非平衡状态,白色獭兔群体处于平衡状态.青紫蓝兔群体为中度多态信息含量(0.25＜PIC＜0.50),白色獭兔群体为低度多态信息含量(PIC＜0.25).[结论]Tyrp1基因对獭兔的毛色有一定的影响.该研究结果可为獭兔毛色的选种选育提供一定的参考.