胃癌DNA甲基化亚型及风险预测模型的建立

摘要

目的探讨不同DNA甲基化水平对胃癌病人预后的影响并据此建立风险预测模型。方法根据DNA甲基化水平差异使用一致性聚类方法将癌症基因组图谱(TCGA)数据库中407例胃癌样本划分为不同的DNA甲基化亚型,同时结合病人预后信息得出预后相关甲基化位点,建立Cox预后风险模型。结果将胃癌病人分为7个DNA甲基化亚型,不同的DNA甲基化亚型病人的预后存在差异(P<0.05),高DNA甲基化水平的病人总生存率更高。同时基于DNA甲基化预后相关位点建立了胃癌病人DNA甲基化Cox风险预测模型,将病人分为高风险组及低风险组,高风险组病人预后较低风险组病人预后差(P<0.05)。结论cg12645220、cg20727114、cg26535072是胃癌病人预后相关DNA甲基化位点基因,风险评分是胃癌病人预后的独立预后因素,同时与数种免疫细胞含量相关。