肥胖患者内脏脂肪细胞来源的外泌体miRNAs表达谱分析

摘要

目的 探讨肥胖人群内脏脂肪细胞分泌的外泌体中miRNAs表达谱的改变,寻找与肥胖相关的差异表达miRNAs,为肥胖及其相关疾病发病机制的探讨和有效预防提供理论基础.方法 运用R/Bioconductor软件平台对美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共数据平台中的GEO芯片数据集GSE50574进行差异miRNAs表达谱分析,使用3个主要的生物信息学网站(TargetScan、miRDB和miRWalk)对差异表达miRNAs进行靶基因预测,基于Cytoscape软件构建差异表达miRNAs-target genes调控网络,通过DAVID注释工具对网络中的基因进行功能注释.结果 与健康对照相比,肥胖患者内脏脂肪细胞分泌的外泌体miRNAs表达谱显示19个miRNAs表达水平发生显著变化(倍数改变＞2,P＜0.05),其中1个miRNA表达水平上调,18个miRNAs表达水平下调.借助于miRNA靶基因预测网站对19个差异表达miRNAs靶基因进行预测,共得到潜在靶基因919个.分别对表达上调和下调的两组差异表达miRNAs及其靶基因进行调控网络图的绘制和DAVID功能注释,结果提示上调组miRNA分别参与了3个KEGG通路和17个基因本体论(GO)_生物学过程(BP)、5个GO细胞组分(CC)、9个GO_分子功能(MF)注释条目(P＜0.05),下调组miRNAs分别参与了13个KEGG通路和73个GO_BP、18个GO CC、30个GO_MF注释条目(P＜0.05).结论 肥胖患者内脏脂肪细胞分泌的外泌体miRNAs表达谱系与健康对照具有显著差异.借助高通量组学和相关数据库的联合运用,对内脏脂肪细胞及其功能作用有了更深入的了解,并为肥胖及肥胖相关疾病的发病机制研究提供了新的视角.